Protein–RNA interactions for Protein: O08580

Esrra, Steroid hormone receptor ERR1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrraO08580 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EsrraO08580 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EsrraO08580 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EsrraO08580 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EsrraO08580 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EsrraO08580 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EsrraO08580 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EsrraO08580 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EsrraO08580 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EsrraO08580 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EsrraO08580 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EsrraO08580 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EsrraO08580 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrraO08580 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EsrraO08580 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EsrraO08580 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrraO08580 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrraO08580 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrraO08580 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrraO08580 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms