Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mfsd4b4J3QNS5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mfsd4b4J3QNS5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mfsd4b4J3QNS5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms