Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r6H3BK29 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r6H3BK29 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r6H3BK29 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn2r6H3BK29 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r6H3BK29 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r6H3BK29 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r6H3BK29 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r6H3BK29 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms