Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dcdc2bF7BCK0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dcdc2bF7BCK0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dcdc2bF7BCK0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dcdc2bF7BCK0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dcdc2bF7BCK0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dcdc2bF7BCK0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Dcdc2bF7BCK0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dcdc2bF7BCK0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Dcdc2bF7BCK0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Dcdc2bF7BCK0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dcdc2bF7BCK0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dcdc2bF7BCK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Dcdc2bF7BCK0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dcdc2bF7BCK0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dcdc2bF7BCK0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dcdc2bF7BCK0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dcdc2bF7BCK0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dcdc2bF7BCK0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms