Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nolc1E9Q5C9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nolc1E9Q5C9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nolc1E9Q5C9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nolc1E9Q5C9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nolc1E9Q5C9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nolc1E9Q5C9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Nolc1E9Q5C9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nolc1E9Q5C9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nolc1E9Q5C9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nolc1E9Q5C9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nolc1E9Q5C9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nolc1E9Q5C9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms