Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cfap70D3YVL2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cfap70D3YVL2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cfap70D3YVL2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cfap70D3YVL2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cfap70D3YVL2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cfap70D3YVL2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap70D3YVL2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms