Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd34aB2RW11 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd34aB2RW11 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd34aB2RW11 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ankrd34aB2RW11 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ankrd34aB2RW11 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ankrd34aB2RW11 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ankrd34aB2RW11 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ankrd34aB2RW11 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ankrd34aB2RW11 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ankrd34aB2RW11 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ankrd34aB2RW11 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd34aB2RW11 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ankrd34aB2RW11 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ankrd34aB2RW11 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ankrd34aB2RW11 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms