Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CK137956B1AYM9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CK137956B1AYM9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CK137956B1AYM9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CK137956B1AYM9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CK137956B1AYM9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CK137956B1AYM9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CK137956B1AYM9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CK137956B1AYM9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CK137956B1AYM9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CK137956B1AYM9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CK137956B1AYM9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CK137956B1AYM9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms