Protein–RNA interactions for Protein: B1AR17

Chd3, Chromodomain helicase DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd3B1AR17 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chd3B1AR17 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd3B1AR17 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd3B1AR17 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chd3B1AR17 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chd3B1AR17 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chd3B1AR17 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms