Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Supt3B0QZW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Supt3B0QZW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Supt3B0QZW4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Supt3B0QZW4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt3B0QZW4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt3B0QZW4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms