Protein–RNA interactions for Protein: B0QZF7

Proca1, Protein PROCA1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proca1B0QZF7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Proca1B0QZF7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Proca1B0QZF7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Proca1B0QZF7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Proca1B0QZF7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms