Protein–RNA interactions for Protein: A9C473

A630010A05Rik, RIKEN cDNA A630010A05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630010A05RikA9C473 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A630010A05RikA9C473 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A630010A05RikA9C473 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
A630010A05RikA9C473 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A630010A05RikA9C473 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A630010A05RikA9C473 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms