Protein–RNA interactions for Protein: A6X935

Itih4, Inter alpha-trypsin inhibitor, heavy chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itih4A6X935 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itih4A6X935 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Itih4A6X935 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itih4A6X935 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itih4A6X935 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itih4A6X935 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itih4A6X935 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itih4A6X935 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms