Protein–RNA interactions for Protein: A6H6E9

Ttc23l, Tetratricopeptide repeat protein 23-like, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc23lA6H6E9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc23lA6H6E9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc23lA6H6E9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc23lA6H6E9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc23lA6H6E9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc23lA6H6E9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc23lA6H6E9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc23lA6H6E9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc23lA6H6E9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc23lA6H6E9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc23lA6H6E9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttc23lA6H6E9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms