Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Palm3A2TJV2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Palm3A2TJV2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Palm3A2TJV2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Palm3A2TJV2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Palm3A2TJV2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Palm3A2TJV2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms