Protein–RNA interactions for Protein: A2CGC2

Btbd35f3, BTB domain-containing 35, family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f3A2CGC2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Btbd35f3A2CGC2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Btbd35f3A2CGC2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Btbd35f3A2CGC2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Btbd35f3A2CGC2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Btbd35f3A2CGC2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Btbd35f3A2CGC2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Btbd35f3A2CGC2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Btbd35f3A2CGC2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Btbd35f3A2CGC2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms