Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ism1A2ATD1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ism1A2ATD1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ism1A2ATD1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ism1A2ATD1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ism1A2ATD1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms