Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lgr4A2ARI4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lgr4A2ARI4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lgr4A2ARI4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr4A2ARI4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lgr4A2ARI4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms