Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rtf1A2AQ19 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rtf1A2AQ19 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Rtf1A2AQ19 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Rtf1A2AQ19 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rtf1A2AQ19 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms