Protein–RNA interactions for Protein: A2AHJ4

Brwd3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brwd3A2AHJ4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Brwd3A2AHJ4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Brwd3A2AHJ4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Brwd3A2AHJ4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Brwd3A2AHJ4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Brwd3A2AHJ4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Brwd3A2AHJ4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Brwd3A2AHJ4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Brwd3A2AHJ4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Brwd3A2AHJ4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Brwd3A2AHJ4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Brwd3A2AHJ4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Brwd3A2AHJ4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Brwd3A2AHJ4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Brwd3A2AHJ4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Brwd3A2AHJ4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Brwd3A2AHJ4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Brwd3A2AHJ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Brwd3A2AHJ4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Brwd3A2AHJ4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Brwd3A2AHJ4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Brwd3A2AHJ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Brwd3A2AHJ4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Brwd3A2AHJ4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Brwd3A2AHJ4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Brwd3A2AHJ4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Brwd3A2AHJ4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Brwd3A2AHJ4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Brwd3A2AHJ4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Brwd3A2AHJ4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Brwd3A2AHJ4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Brwd3A2AHJ4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Brwd3A2AHJ4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Brwd3A2AHJ4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Brwd3A2AHJ4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Brwd3A2AHJ4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Brwd3A2AHJ4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Brwd3A2AHJ4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Brwd3A2AHJ4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Brwd3A2AHJ4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms