Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RlfA2A7F4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RlfA2A7F4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RlfA2A7F4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RlfA2A7F4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RlfA2A7F4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms