Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssc4dA1L0T3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ssc4dA1L0T3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ssc4dA1L0T3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ssc4dA1L0T3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ssc4dA1L0T3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ssc4dA1L0T3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms