Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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