Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPA5

Gm28961, Predicted gene 28961, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28961A0A087WPA5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,22■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Gm28961A0A087WPA5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20,16■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,82
Gm28961A0A087WPA5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20,14■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20,13■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,13■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20,11■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,1■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20,09■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,09■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20,09■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Gm28961A0A087WPA5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,07■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,06■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,05■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,03■□□□□ 0,8
Gm28961A0A087WPA5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,03■□□□□ 0,8
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