Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm28510A0A087WP28 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm28510A0A087WP28 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm28510A0A087WP28 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm28510A0A087WP28 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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