Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ighv5-6A0A075B5Q0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms