RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SBSNQ6UWP8 590 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ADIPOR2Q86V24 386 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SPNS2Q8IVW8 549 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ICA1LQ8NDH6 482 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 HIPK4Q8NE63 616 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP76Q8TAP6 659 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM15Q9C019 465 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CIPCQ9C0C6 399 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 Q9H521 79 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPN10Q9HC96 672 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DTNAQ9Y4J8 743 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 GON4LQ3T8J9 2241 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ANGPT2O15123 496 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6AP2O75787 350 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 POP4O95707 220 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 C7P10643 843 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD17B1P14061 328 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 BPIP17213 487 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CD70P32970 193 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 RBBP7Q16576 425 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 C22orf39Q6P5X5 142 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TICAM1Q8IUC6 712 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 NXPE1Q8N323 547 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA12BQ96MM6 686 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 EFHD1Q9BUP0 239 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SUV39H2Q9H5I1 410 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A14Q9UN76 642 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 OTCP00480 354 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 PEX2P28328 305 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 NSG1P42857 185 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 VASPP50552 380 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 GRB7Q14451 532 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 GPRC6AQ5T6X5 926 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SULT1C3Q6IMI6 304 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM154Q6P9G4 183 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM151BQ6UXP7 276 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM54Q9BYV2 358 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM245Q9H330 911 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PP18 115 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 FFAR2O15552 330 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CD6P30203 668 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 PIK3CGP48736 1102 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 MED21Q13503 144 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 RCAN2Q14206 197 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SFT2D3Q587I9 215 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB2Q8N680 514 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC52A3Q9NQ40 469 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD5Q9NXV2 234 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF225Q9UK10 706 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB26Q9ULW5 256 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 AQP12BA6NM10 295 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 DENRO43583 198 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR47O94967 919 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN7O95471 211 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV3-19P01714 112 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00032P0C843 101 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 NFKBIAP25963 317 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC7A1P30825 629 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 AGTR2P50052 363 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SHC2P98077 582 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CARD16Q5EG05 197 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 ARPINQ7Z6K5 226 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 AQP12AQ8IXF9 295 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SIPA1Q96FS4 1042 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNA7Q96RP8 456 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 FSCN3Q9NQT6 498 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TPRP12270 2363 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFS2O75306 463 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CFIP05156 583 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 EPHX1P07099 455 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 TPMTP51580 245 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 LPCAT4Q643R3 524 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 CRTC1Q6UUV9 634 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA24Q86W54 205 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 PAF1Q8N7H5 531 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-204ENST00000587718 OR9I1Q8NGQ6 314 aa24.84■■□□□ 1.57
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