RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CR2P20023 1033 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PRPS1L1P21108 318 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 HSD3B2P26439 372 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 TIE1P35590 1138 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CTSKP43235 329 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FCGRTP55899 365 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MTPNP58546 118 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 AP1S1P61966 158 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS14P62263 151 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 NKX3-2P78367 333 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MAP2K5Q13163 448 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SP140Q13342 867 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MEP1AQ16819 746 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF544Q6NX49 715 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXL22Q6P050 247 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ERAP2Q6P179 960 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FAHD1Q6P587 224 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF540Q8NDQ6 660 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2T11Q8NH01 316 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXO30Q8TB52 745 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PLD4Q96BZ4 506 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO19Q96H55 970 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 OR52E6Q96RD3 313 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CSF3RQ99062 836 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 HTATIP2Q9BUP3 242 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CD244Q9BZW8 370 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 P2RY12Q9H244 342 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ACTL8Q9H568 366 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CWH43Q9H720 699 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 IPPKQ9H8X2 491 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 KRT84Q9NSB2 600 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 GALPQ9UBC7 116 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM50BQ9Y247 325 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 MED16Q9Y2X0 877 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 TIMM22Q9Y584 194 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ARL5AQ9Y689 179 aa7.56□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A075B6Q4 140 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PQ67 120 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 AGAP5A6NIR3 686 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 METTL15A6NJ78 407 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC34A8MYJ7 566 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM25AB3EWG3 89 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM25CB3EWG5 89 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM25GB3EWG6 89 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SNPHO15079 494 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC16A5O15375 505 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 SEC22BO75396 215 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 RFPL2O75678 378 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 INMTO95050 263 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 CLDN9O95484 217 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 IFNA14P01570 189 aa7.55□□□□□ -1.2
CAPNS1-202ENST00000586851 C8GP07360 202 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms