RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576390.5

P4HB-223, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 4 BASIC

Gene P4HB, Length 439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-223	ENST00000576390	HOOK3	Q86VS8	718 aa		18.25	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		18.25	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		18.25	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SGSM3	Q96HU1	749 aa		18.25	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	IP6K3	Q96PC2	410 aa		18.25	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		18.25	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	OR1I1	O60431	355 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SUN1	O94901	812 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	AGFG2	O95081	481 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	OR56A5	P0C7T3	313 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	OTX2	P32243	289 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	CCZ1B	P86790	482 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ACVR1	Q04771	509 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	CDH17	Q12864	832 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	KIR2DS3	Q14952	304 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	HES6	Q96HZ4	224 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	RANBP9	Q96S59	729 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	MENT	Q9BUN1	341 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	MFRP	Q9BY79	579 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	LUZP4	Q9P127	313 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	CDYL	Q9Y232	598 aa		18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	HEATR9	A2RTY3	570 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SEMA7A	O75326	666 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	FTCD	O95954	541 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	CD63	P08962	238 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	DCAF10	Q5QP82	559 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	C1orf189	Q5VU69	101 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	MLIP	Q5VWP3	458 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF534	Q76KX8	674 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	HDAC10	Q969S8	669 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ISM1	B1AKI9	464 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	GPC4	O75487	556 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	RNF224	P0DH78	156 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	PKLR	P30613	574 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	CCR7	P32248	378 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	FOLR3	P41439	243 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SOX8	P57073	446 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	GRB7	Q14451	532 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	KYNU	Q16719	465 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SYTL3	Q4VX76	610 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ZNF778	Q96MU6	729 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	KDM1A	O60341	852 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ONECUT2	O95948	504 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	IGHE	P01854	428 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	UMOD	P07911	640 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	CCDC175	P0C221	793 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	ADRA1D	P25100	572 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	FDFT1	P37268	417 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	GRIA1	P42261	906 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	RAB28	P51157	221 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	RAPSN	Q13702	412 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	SEMA3A	Q14563	771 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	MYBPC3	Q14896	1274 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		18.21	■□□□□ 0.51
P4HB-223	ENST00000576390	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		18.21	■□□□□ 0.51

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