RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	CACNG1	Q06432	222 aa		12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	PRKG2	Q13237	762 aa		12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	DPYSL3	Q14195	570 aa		12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	BCL7A	Q4VC05	210 aa		12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	HGH1	Q9BTY7	390 aa		12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	SMOX	Q9NWM0	555 aa		12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	IL17C	Q9P0M4	197 aa		12.68	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A0J9YY10	115 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	SGTA	O43765	313 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	UQCRH	P07919	91 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	MYBL2	P10244	700 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	FDXR	P22570	491 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	NSG1	P42857	185 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	FOLH1	Q04609	750 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	NOMO1	Q15155	1222 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	CEBPE	Q15744	281 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	ATG9B	Q674R7	924 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	HM13	Q8TCT9	377 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	AGAP11	Q8TF27	550 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	NINJ1	Q92982	152 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	GPR137	Q96N19	417 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF559	Q9BR84	538 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	CRB3	Q9BUF7	120 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF32	Q9H0A6	362 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	TRABD	Q9H4I3	376 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	EURL	Q9NYK6	297 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	ICK	Q9UPZ9	632 aa		12.67	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM227A	F5H4B4	570 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	DSCR3	O14972	297 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	SLCO2B1	O94956	709 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	BMP10	O95393	424 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	SERPINA7	P05543	415 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	TPM2	P07951	284 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	OR1D4	P47884	311 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	KLC1	Q07866	573 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF398	Q8TD17	642 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	BTBD6	Q96KE9	485 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	SMR3A	Q99954	134 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	CUTC	Q9NTM9	273 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		12.66	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	JMJD1C	Q15652	2540 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	OR5H15	A6NDH6	313 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276		E9PLN8	166 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNHIT1	O43257	154 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	WFS1	O76024	890 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	CELA2A	P08217	269 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	COX6A1	P12074	109 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	GZMA	P12544	262 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	FANCC	Q00597	558 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC14A2	Q15849	920 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF766	Q5HY98	468 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	CES4A	Q5XG92	561 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	BIVM	Q86UB2	503 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	PQLC3	Q8N755	202 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
FAM53C-208	ENST00000511276	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		12.65	□□□□□ -0.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms