RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SNX30Q5VWJ9 437 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ATG14Q6ZNE5 492 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DPPA4Q7L190 304 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NXPE1Q8N323 547 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OR4C6Q8NH72 309 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 METTL6Q8TCB7 284 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CHTF18Q8WVB6 975 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SELENOMQ8WWX9 145 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAIM2Q9BWQ8 316 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EPHA6Q9UF33 1036 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 H7BY64 318 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CISD3P0C7P0 127 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TPBGLP0DKB5 382 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TFPIP10646 304 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MAGP20916 626 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CPN2P22792 545 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 METAP1P53582 386 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CDK16Q00536 496 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF33BQ06732 778 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FIGLAQ6QHK4 219 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CROCCP2Q86T23 111 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IQCHQ86VS3 1027 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CPNE9Q8IYJ1 553 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SEC14L1Q92503 715 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC39A7Q92504 469 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MOCOSQ96EN8 888 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PRAP1Q96NZ9 151 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DPH7Q9BTV6 452 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PCBD2Q9H0N5 130 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EPB41L1Q9H4G0 881 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FANCFQ9NPI8 374 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DTNAQ9Y4J8 743 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQF6 199 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ACOT7O00154 380 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 B3GALT2O43825 422 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 STK17BO94768 372 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC166P0CW27 439 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCKBRP32239 447 aa4.33□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 BDKRB1P46663 353 aa4.33□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 OR1D4P47884 311 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT2Q10471 571 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MYBPHQ13203 477 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TCTE1Q5JU00 501 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TSTD2Q5T7W7 516 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CSNK1A1LQ8N752 337 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CEP70Q8NHQ1 597 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 INPP5DQ92835 1189 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EXTL1Q92935 676 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD3Q96ES6 412 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM14Q96QK8 99 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DKK3Q9UBP4 350 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1HQ9UI12 483 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 C3orf18Q9UK00 162 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KLK13Q9UKR3 277 aa4.33□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 A1L4Q6 167 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PSMD11O00231 422 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF10CO14798 259 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFS4O43181 175 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NIPSNAP2O75323 286 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NME1P15531 152 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 BPIP17213 487 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEA4P43358 317 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KCNC4Q03721 635 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ITIH4Q14624 930 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CARTPTQ16568 116 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PFKFB4Q16877 469 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 POMZP3Q6PJE2 187 aa4.32□□□□□ -1.72
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