RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 VIPP01282 170 aa8.29□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 CREB1P16220 341 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CYP2A7P20853 494 aa8.29□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 HIST1H2ADP20671 130 aa8.28□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 ISCA2Q86U28 154 aa8.28□□□□□ -1.08
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SGMS1-211ENST00000626236 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 BANPQ8N9N5 519 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC63Q8NA47 563 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 AVL9Q8NBF6 648 aa8.28□□□□□ -1.08
SGMS1-211ENST00000626236 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.28□□□□□ -1.08
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