RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 FCGR1BQ92637 280 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SSX3Q99909 188 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAPPC6AO75865 159 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 UGT2B4P06133 528 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 CD36P16671 472 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 RPIAP49247 311 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC26A5P58743 744 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TEAD4Q15561 434 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 IQCCQ4KMZ1 466 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 CENPSQ8N2Z9 138 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PDYNP01213 254 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 KHKP50053 298 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 LUMP51884 338 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ODF4Q2M2E3 257 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF670Q9BS34 389 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 H3BUI4 141 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC9A3P48764 834 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 CPA6Q8N4T0 437 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB2Q8N680 514 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB21Q9UL25 225 aa18.3■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGEB17A8MXT2 336 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 GRM6O15303 877 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SPATA31D3P0C874 917 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TNFRSF8P28908 595 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PRSS58Q8IYP2 241 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB2BQ8WUD1 216 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 APODP05090 189 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SFTPBP07988 381 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 HSPA7P48741 367 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ATAT1Q5SQI0 421 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM145Q8NBT3 493 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 DCAKDQ8WVC6 231 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ARL8BQ9NVJ2 186 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SH2B3Q9UQQ2 575 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 CAPN14A8MX76 684 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SHC3Q92529 594 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SERINC1Q9NRX5 453 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXO5Q9UKT4 447 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 CXCR1P25024 350 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 RARRES1P49788 294 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 CLCN4P51793 760 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB4BP61018 213 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 BEX3Q00994 111 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR153Q6NV75 609 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TUBG2Q9NRH3 451 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SIRPGQ9P1W8 387 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ILVBLA1L0T0 632 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SCDO00767 359 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 LATS1O95835 1130 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ECH1Q13011 328 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZPBP2Q6X784 338 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 GNG8Q9UK08 70 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PLLPQ9Y342 182 aa18.29■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM149AA5PLN7 773 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SCAMP1O15126 338 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ASGR1P07306 291 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 LRP8Q14114 963 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TAS2R14Q9NYV8 317 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TRAV6A0A075B6T7 132 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TLL1O43897 1013 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 GPIP06744 558 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 RIOX2Q8IUF8 465 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 NETO2Q8NC67 525 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ADH1AP07327 375 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM199Q8N511 208 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ATAD1Q8NBU5 361 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 AGBL3Q8NEM8 1001 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 C15orf40Q8WUR7 153 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 HHLA1C9JL84 531 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRJ-207ENST00000613246 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms