RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC53A6NM62 1247 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 STMND1H3BQB6 276 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 PDHA1P08559 390 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 THRAP10827 490 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 DESP17661 470 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 CD40P25942 277 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ALDH4A1P30038 563 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 GNPDA1P46926 289 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 FASLGP48023 281 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 POLD2P49005 469 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ARSEP51690 589 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 MAPK10P53779 464 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP4F2P78329 520 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.46e-10■■■■■ 32.4
PRPF40A-210ENST00000489741 RIN1Q13671 783 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 GRM7Q14831 915 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 CLCA4Q14CN2 919 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 AMZ1Q400G9 498 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 PYCR3Q53H96 274 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 MANEAQ5SRI9 462 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 VASH2Q86V25 355 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 SFRP1Q8N474 314 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 BMPERQ8N8U9 685 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TEKT4Q8WW24 435 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 MAML1Q92585 1016 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 FATE1Q969F0 183 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR24Q96S15 920 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ABCG8Q9H221 673 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS11Q9H270 941 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 A6NCN8 305 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 B4E171 279 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ZW10O43264 779 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC6O75061 913 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 EML2O95834 649 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 MYBL1P10243 752 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF30P17039 623 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 UGT1A3P35503 534 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TSPAN7P41732 249 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 STC1P52823 247 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 CDH6P55285 790 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 MAXP61244 160 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXL1Q12952 345 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 PEX6Q13608 980 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF235Q14590 738 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 STX1AQ16623 288 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 NRN1LQ496H8 165 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 MARC1Q5VT66 337 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 IYDQ6PHW0 289 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 NRSN1Q8IZ57 195 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 D2HGDHQ8N465 521 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 SCAMP4Q969E2 229 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TSGA13Q96PP4 275 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 SMIM14Q96QK8 99 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 LYSMD1Q96S90 227 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 AGAP2Q99490 1192 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 DDA1Q9BW61 102 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 ZMAT4Q9H898 229 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 AMACRQ9UHK6 382 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 SCINQ9Y6U3 715 aa6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A0J9YYE9 177 aa6.28□□□□□ -1.4
PRPF40A-210ENST00000489741 TRBC1P01850 177 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms