RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 EPHA4P54764 986 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 GPX6P59796 221 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 MGAT5Q09328 741 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 HSPA14Q0VDF9 509 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM129CQ86XR2 697 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF843Q8N446 348 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 ASZ1Q8WWH4 475 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 B3GNT4Q9C0J1 378 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 KLHL3Q9UH77 587 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 MED16Q9Y2X0 877 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa26.44■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 SLCO2B1O94956 709 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 AHSGP02765 367 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 APOA4P06727 396 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 CD82P27701 267 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 C19orf57Q0VDD7 668 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 MANEAQ5SRI9 462 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 GALNT7Q86SF2 657 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC22A15Q8IZD6 547 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 BMPERQ8N8U9 685 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 PHC3Q8NDX5 983 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM136AQ96C01 138 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 LATS2Q9NRM7 1088 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC39A1Q9NY26 324 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 OGFRQ9NZT2 677 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa26.43■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 ATMQ13315 3056 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 RHOXF2BP0C7M4 288 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 CHRM3P20309 590 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 TMED2Q15363 201 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 OTOAQ7RTW8 1153 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 ZFPM2Q8WW38 1151 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 WBP1Q96G27 269 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 RHOXF2Q9BQY4 288 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 SMYD2Q9NRG4 433 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa26.42■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 KPNA5O15131 536 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 GSTA2P09210 222 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 CLCN7P51798 805 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKS6Q68DC2 871 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 SPNS2Q8IVW8 549 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 FERD3LQ96RJ6 166 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC68Q9H2F9 335 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 ZFATQ9P243 1243 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 PSAT1Q9Y617 370 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 COMMD10Q9Y6G5 202 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa26.41■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 B4E171 279 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 STMND1H3BQB6 276 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 KALRNO60229 2985 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 UBXN7O94888 489 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 C1QAP02745 245 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 NDUFS1P28331 727 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 TSPAN7P41732 249 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 GFERP55789 205 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 GBX1Q14549 363 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 CYS1Q717R9 158 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNJ9Q92806 393 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 NKD1Q969G9 470 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC30A3Q99726 388 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 CTRCQ99895 268 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 DDA1Q9BW61 102 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 EPB41L1Q9H4G0 881 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC24A2Q9UI40 661 aa26.4■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 E5RI56 91 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 PIAS1O75925 651 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 TYRP1P17643 537 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 CUL1Q13616 776 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT33BQ14525 404 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 IFT20Q8IY31 132 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBTB2Q8N680 514 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 GIMAP7Q8NHV1 300 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 FMO2Q99518 471 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 NDNQ99608 321 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 MVB12BQ9H7P6 319 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa26.39■■□□□ 1.82
GNPTAB-202ENST00000392919 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-202ENST00000392919 ABRQ12979 859 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-202ENST00000392919 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-202ENST00000392919 OR5AR1Q8NGP9 310 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-202ENST00000392919 RSC1A1Q92681 617 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-202ENST00000392919 APMAPQ9HDC9 416 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-202ENST00000392919 KLHL42Q9P2K6 505 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-202ENST00000392919 ASF1AQ9Y294 204 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-202ENST00000392919 CFAP46Q8IYW2 2715 aa26.38■■□□□ 1.81
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM159BA6NKW6 160 aa26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms