RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.56□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 NXNL1Q96CM4 212 aa7.56□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa7.56□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.56□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ALG9Q9H6U8 611 aa7.56□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TSC2P49815 1807 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 A0A1W2PPW3 197 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 RAD51BO15315 384 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TYROBPO43914 113 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ALX3O95076 343 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 FKBP9O95302 570 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 S1PR4O95977 384 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC26A3P40879 764 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC1A6P48664 564 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 P2RX3P56373 397 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 MYBPC1Q00872 1141 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF846Q147U1 533 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 GRIN2CQ14957 1233 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 AAK1Q2M2I8 961 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 LSMEM2Q8N112 164 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF786Q8N393 782 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 GPR150Q8NGU9 434 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 HLA-CQ95604 372 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 PHF21BQ96EK2 531 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 C12orf10Q9HB07 376 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 COPG2Q9UBF2 871 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 XPR1Q9UBH6 696 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 VPS4AQ9UN37 437 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 A0A1W2PPC1 479 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 SNPHO15079 494 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 DLGAP3O95886 979 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ADH1BP00325 375 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 DRD1P21728 446 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 NTSR1P30989 418 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 BMXP51813 675 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 MAPK10P53779 464 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBCCQ15814 346 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 FBXO43Q4G163 708 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 IGSF11Q5DX21 431 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 EOGTQ5NDL2 527 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 SNX32Q86XE0 403 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 GPSM1Q86YR5 675 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CADM3Q8N126 398 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 FBXO39Q8N4B4 442 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC15A4Q8N697 577 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TMIEQ8NEW7 156 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 OR13J1Q8NGT2 312 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 GPR21Q99679 349 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 CD84Q9UIB8 345 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 RGSL1A5PLK6 1076 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 HOXB2P14652 356 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 ITGAXP20702 1163 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TTKP33981 857 aa7.55□□□□□ -1.2
SLC13A3-202ENST00000290317 TNFRSF4P43489 277 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms