RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 WDR26Q9H7D7 661 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TDP1Q9NUW8 608 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LCHNA4D1U4 455 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 E7ESA3 106 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DCLK1O15075 740 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ALOX12P18054 663 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ALDH4A1P30038 563 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EOGTQ5NDL2 527 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DCST1Q5T197 706 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LPCAT4Q643R3 524 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 COMMD2Q86X83 199 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ASB9Q96DX5 294 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 B3GALT6Q96L58 329 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 H0YGN5 161 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LEFTY2O00292 366 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CCNB2O95067 398 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ALPPL2P10696 532 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CYBAP13498 195 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CYP4F2P78329 520 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GSTM4Q03013 218 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SEMA3AQ14563 771 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IFI44LQ53G44 452 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OAFQ86UD1 273 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1191Q96A73 305 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 S100A13Q99584 98 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DUSP26Q9BV47 211 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OR2AG1Q9H205 316 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ABCG8Q9H221 673 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SATB2Q9UPW6 733 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NFS1Q9Y697 457 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BCORQ6W2J9 1755 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AHSGP02765 367 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GALTP07902 379 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NR2F6P10588 404 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AOC1P19801 751 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RNF186Q9NXI6 227 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GABRQQ9UN88 632 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 A8MUI8 341 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EBLN1P0CF75 366 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC7A1P30825 629 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RGS21Q2M5E4 152 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CEP68Q76N32 757 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BNIPLQ7Z465 357 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 HID1Q8IV36 788 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C12orf66Q96MD2 445 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RGS10O43665 173 aa6.35□□□□□ -1.39
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