RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEAD2Q15562 447 aa16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LIX1Q8N485 282 aa16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GTF2H4Q92759 462 aa16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCEAL4Q96EI5 215 aa16.12■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC115Q96NT0 180 aa16.12■□□□□ 0.17
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