RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	SNX1	Q13596	522 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344		Q6ZS92	163 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF567	Q8N184	647 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GALNT16	Q8N428	558 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	TM9SF4	Q92544	642 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GLYATL1	Q969I3	302 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CD180	Q99467	661 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	E2F3	O00716	465 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	RORA	P35398	523 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	NCF4	Q15080	339 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	QPCT	Q16769	361 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GPR26	Q8NDV2	337 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	OR5K3	A6NET4	321 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344		C9J4A7	227 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	MASP2	O00187	686 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	KLHL41	O60662	606 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CDK14	O94921	469 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SLC4A1	P02730	911 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	MMP2	P08253	660 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	VCL	P18206	1134 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	NFKB1	P19838	968 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CD86	P42081	329 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	RPE65	Q16518	533 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GRHL3	Q8TE85	626 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	EID2B	Q96D98	161 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PPM1M	Q96MI6	270 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	FCRL5	Q96RD9	977 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1B0GUH1	482 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	LDB2	O43679	373 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	VEGFD	O43915	354 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	TUBB4A	P04350	444 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	EDN3	P14138	238 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CYP2A7	P20853	494 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	PTGER4	P35408	488 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	GDF10	P55107	478 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CREG2	Q8IUH2	290 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	OR1L3	Q8NH93	324 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	TADA1	Q96BN2	335 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBM3-208	ENST00000489344	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		13.42	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms