RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL27RAQ6UWB1 636 aa15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERMP1Q7Z2K6 904 aa15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPHX4Q8IUS5 362 aa15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM126BQ8IUX1 230 aa15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PYCR2Q96C36 320 aa15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ROPN1LQ96C74 230 aa15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EGFL8Q99944 293 aa15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL23AQ9NPF7 189 aa15.22■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HLA-EP13747 358 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FASP25445 335 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPM1AP35813 382 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLCN7P51798 805 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFKB2Q00653 900 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFATC2Q13469 925 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPPE1Q53F39 396 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LPCAT2Q7L5N7 544 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 METTL6Q8TCB7 284 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF145Q96MT1 663 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STOML2Q9UJZ1 356 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FADS3Q9Y5Q0 445 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FUOMA2VDF0 154 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASPDHA6ND91 283 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GFRA2O00451 464 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AXIN1O15169 862 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC22A3O75751 556 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEBPBP17676 345 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC26A3P40879 764 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPA14Q0VDF9 509 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HTR3DQ70Z44 454 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DMTF1Q9Y222 760 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR45Q9Y5Y3 372 aa15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LTBP2Q14767 1821 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WASH3PC4AMC7 463 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPN1P07384 714 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGF4P08620 206 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF23P17027 643 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL12AP29459 219 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMD8P48556 350 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOFQ13790 326 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NR6A1Q15406 480 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OGFOD2Q6N063 350 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CARM1Q86X55 608 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHEBL1Q8TAI7 183 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DERL2Q9GZP9 239 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TDP1Q9NUW8 608 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HACD3Q9P035 362 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCTPQ9UKL6 214 aa15.21■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR2AG2A6NM03 316 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGSF6O95976 241 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OCM2P0CE71 109 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C12orf40Q86WS4 652 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF175Q8N4F7 328 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBCCD1Q9NVR7 557 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4GALT6Q9UBX8 382 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLCN4P51793 760 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTSQ03393 145 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM240Q5SV17 173 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FIBINQ8TAL6 211 aa15.2■□□□□ 0.02
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPPL3Q8TCT6 385 aa15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms