RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481037.5

RBM39-232, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-232ENST00000481037 ARL2P36404 184 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 HDAC4P56524 1084 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 ALKAL1Q6UXT8 129 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 DSG4Q86SJ6 1040 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 PMM1Q92871 262 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SERAC1Q96JX3 654 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CATSPER2Q96P56 530 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 C6orf50Q9HD87 102 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.69□□□□□ -1.5
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RBM39-232ENST00000481037 MDM4O15151 490 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 NVLO15381 856 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 THAP12O43422 761 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 DUX1O43812 170 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 COQ9O75208 318 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 NOL4O94818 638 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 DNTTP04053 509 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 ALPPL2P10696 532 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 HARSP12081 509 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 LIFP15018 202 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 KCNE1P15382 129 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 ITIH1P19827 911 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 DGKAP23743 735 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CIITAP33076 1130 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 ART1P52961 327 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 FAXCQ5TGI0 409 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 NADSYN1Q6IA69 706 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 GUSBP11Q6P575 273 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 TPGS1Q6ZTW0 290 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 TRILQ7L0X0 811 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 NAGSQ8N159 534 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 EXOC6Q8TAG9 804 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 NR4A3Q92570 626 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 INPP5DQ92835 1189 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 HVCN1Q96D96 273 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 IQCDQ96DY2 449 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 LXNQ9BS40 222 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 BBS2Q9BXC9 721 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SGK2Q9HBY8 427 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SPHK2Q9NRA0 654 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 MYO6Q9UM54 1294 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SCN1AP35498 2009 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CCDC69A6NI79 296 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CLCA1A8K7I4 914 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 RHODO00212 210 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 ACKR2O00590 384 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 TCEA3O75764 348 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 NEBLO76041 1014 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 IRF1P10914 325 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 TYMPP19971 482 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 MX1P20591 662 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 PRKCHP24723 683 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CYP2F1P24903 491 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 MST1P26927 711 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 PDX1P52945 283 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SLC7A9P82251 487 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SEMA5AQ13591 1074 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 XKR4Q5GH76 650 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 MRNIPQ6NTE8 343 aa5.67□□□□□ -1.5
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RBM39-232ENST00000481037 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CUZD1Q86UP6 607 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 BBS7Q8IWZ6 715 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 THEM5Q8N1Q8 247 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 OR2T3Q8NH03 318 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 PHF21BQ96EK2 531 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 SENP8Q96LD8 212 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-232ENST00000481037 STRADBQ9C0K7 418 aa5.67□□□□□ -1.5
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