RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 LY6DQ14210 128 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R7Q15435 360 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 CTSL3PQ5NE16 218 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM73Q86UV7 250 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 AMIGO1Q86WK6 493 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa23.2■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 GALNT6Q8NCL4 622 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ZPBPQ9BS86 351 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 CARD6Q9BX69 1037 aa23.2■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 POMT2Q9UKY4 750 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 CES2O00748 559 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 FANCGO15287 622 aa23.19■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF789Q5FWF6 425 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 NAT8LQ8N9F0 302 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 CD180Q99467 661 aa23.19■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 IL17BQ9UHF5 180 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 BAHCC1Q9P281 2608 aa23.19■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 MCUQ8NE86 351 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 EXTL1Q92935 676 aa23.18■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 GALPQ9UBC7 116 aa23.18■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 SDR42E2A6NKP2 422 aa23.17■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 ACTR10Q9NZ32 417 aa23.17■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 RARRES3Q9UL19 164 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT87PA6NCN2 255 aa23.16■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 CENPUQ71F23 418 aa23.16■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa23.16■■□□□ 1.3
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SH3BP5-208ENST00000459627 LPGAT1Q92604 370 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 SIGLEC10Q96LC7 697 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 BIRC8Q96P09 236 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 IL17FQ96PD4 163 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 TSSK1BQ9BXA7 367 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC12A9Q9BXP2 914 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 NFS1Q9Y697 457 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 F8W8V4 182 aa23.15■■□□□ 1.3
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