RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 ZBTB2Q8N680 514 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SLC22A17Q8WUG5 538 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 EID2BQ96D98 161 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CCDC138Q96M89 665 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 BEGAINQ9BUH8 593 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LRTM1Q9HBL6 345 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FAM118AQ9NWS6 357 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LMCD1Q9NZU5 365 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 AP3M1Q9Y2T2 418 aa12.85□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 K7EPI3 171 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 E2F6O75461 281 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SEC14L2O76054 403 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 WDR47O94967 919 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 BCL10O95999 233 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 RPL17P18621 184 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CRHBPP24387 322 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LAPTM5Q13571 262 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PHKG1Q16816 387 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 Q6ZNX1 250 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SNX20Q7Z614 316 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ADHFE1Q8IWW8 467 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 EID3Q8N140 333 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CLDN19Q8N6F1 224 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GIPC3Q8TF64 312 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 RAB2BQ8WUD1 216 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CEP295NLQ96MC4 621 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 OR52E6Q96RD3 313 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 OSBPL10Q9BXB5 764 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TM6SF2Q9BZW4 377 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LATS2Q9NRM7 1088 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FAIMQ9NVQ4 179 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TRPS1Q9UHF7 1281 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CRLS1Q9UJA2 301 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PDE10AQ9Y233 779 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 TRIM64BA6NI03 449 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PRKD3O94806 890 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PGLSO95336 258 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GALTP07902 379 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 EBLN1P0CF75 366 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 EPB42P16452 691 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 UGT1A1P22309 533 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 UGT1A4P22310 534 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GSTM2P28161 218 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 OR1D2P34982 312 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 UGT1A3P35503 534 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 UGT1A5P35504 534 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 AP1S1P61966 158 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 NKG7Q16617 165 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ANKDD1AQ495B1 522 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 C16orf87Q6PH81 154 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 GCNT7Q6ZNI0 430 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LRRC8DQ7L1W4 858 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MICU2Q8IYU8 434 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 DDHD1Q8NEL9 900 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 OR6K2Q8NGY2 324 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CLHC1Q8NHS4 586 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SNX19Q92543 992 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 WBP2Q969T9 261 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 ACDQ96AP0 544 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 RHBDF1Q96CC6 855 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 FEM1AQ9BSK4 669 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 LHPPQ9H008 270 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 IKZF5Q9H5V7 419 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 CLMPQ9H6B4 373 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 SRRDQ9UH36 339 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 PRSS21Q9Y6M0 314 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-201ENST00000398741 MANBAO00462 879 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 HS6ST1O60243 411 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 PLD1Q13393 1074 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 NFATC2Q13469 925 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 MOGQ16653 247 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 RUNDC3AQ59EK9 446 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 XAF1Q6GPH4 301 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 TRIM46Q7Z4K8 759 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 MSRB3Q8IXL7 192 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 RGL4Q8IZJ4 473 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 HS3ST5Q8IZT8 346 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-201ENST00000398741 DBF4BQ8NFT6 615 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms