RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SRFP11831 508 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TEAD1P28347 426 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 EPHA3P29320 983 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PIK3CGP48736 1102 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 AP1S2P56377 157 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R38P59533 333 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC16Q13042 620 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RBBP7Q16576 425 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL7AQ4VC05 210 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MAVSQ7Z434 540 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CACUL1Q86Y37 369 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PDPRQ8NCN5 879 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PPM1EQ8WY54 764 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CD244Q9BZW8 370 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 WWOXQ9NZC7 414 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OPTCQ9UBM4 332 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PCTPQ9UKL6 214 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FZD4Q9ULV1 537 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN7Q9Y6W3 813 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MYLKQ15746 1914 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN14A8MX76 684 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 E9PBE3 544 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 K7ESM1 405 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO1CO00159 1063 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A2O15244 555 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SGTAO43765 313 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL41O60662 606 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KATNA1O75449 491 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 STK16O75716 305 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CBX6O95503 412 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SOD1P00441 154 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 OTCP00480 354 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CATP04040 527 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ASGR2P07307 311 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR89BP0CG08 455 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 T-ENOLP0DO92 83 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 UROSP10746 265 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 EPB42P16452 691 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN8P19075 237 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 AOC1P19801 751 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPN4P29074 926 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 AGTR2P50052 363 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSCP53634 463 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 INHBCP55103 352 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NCALDP61601 193 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ABRQ12979 859 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBB3Q13509 450 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PHKG1Q16816 387 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 HORMAD1Q86X24 394 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX9Q8N6V9 391 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK15Q8TD08 544 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ATL1Q8WXF7 558 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 GLMNQ92990 594 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF382Q96SR6 550 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms