RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SMURF2Q9HAU4 748 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GIN1Q9NXP7 522 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ARL5AQ9Y689 179 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF536O15090 1300 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 NEMP2A6NFY4 417 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TFPIP10646 304 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM192Q8IY95 271 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CADM2Q8N3J6 435 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB118Q96PH6 123 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 A8MT66 165 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 USP43Q70EL4 1123 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CCL16O15467 120 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 IGFBP4P22692 258 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SLC18A2Q05940 514 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ACDQ96AP0 544 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC58Q96CX6 371 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35G5Q96KT7 338 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZIM2Q9NZV7 527 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.78■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 SLIT2O94813 1529 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PDPK1O15530 556 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ITM2AO43736 263 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 PUDPQ08623 228 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 MIPEPQ99797 713 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC4AQ9UMR7 237 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FESP07332 822 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 AOC1P19801 751 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 GRIA1P42261 906 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 FOXM1Q08050 763 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 NOBOXO60393 691 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DQB2P05538 268 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 ELNP15502 786 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 CAP1Q01518 475 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 TEX264Q9Y6I9 313 aa20.77■□□□□ 0.92
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT4O43236 478 aa20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 POU2F1P14859 743 aa20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 KHKP50053 298 aa20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 GRB14Q14449 540 aa20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 UBXN11Q5T124 520 aa20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A1O15245 554 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 EBF2Q9HAK2 575 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PIGVQ9NUD9 493 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TLE6Q9H808 572 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRG6 482 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 UFD1Q92890 307 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRA2Q9H9E1 313 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PFDN2Q9UHV9 154 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PCCBP05166 539 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 C8BP07358 591 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 GPX6P59796 221 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 GPR153Q6NV75 609 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 FRRS1Q6ZNA5 592 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 LCN9Q8WX39 176 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 RNF31Q96EP0 1072 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 FBXW2Q9UKT8 454 aa20.76■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 PGLSO95336 258 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 CKMT2P17540 419 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 OR4C6Q8NH72 309 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF384Q8TF68 577 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 OR52B2Q96RD2 323 aa20.75■□□□□ 0.91
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM2Q9C040 744 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms