RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 PKP3Q9Y446 797 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CENPFP49454 3210 aa20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CXCR6O00574 342 aa20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 E2F3O00716 465 aa20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 NTRK1P04629 796 aa20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CLK3P49761 638 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 ACVR1Q04771 509 aa20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CYP4F3Q08477 520 aa20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 KIAA0040Q15053 153 aa20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GPR21Q99679 349 aa20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 NEK6Q9HC98 313 aa20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PMS1-222ENST00000639501 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ASB14A6NK59 587 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 S100BP04271 92 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 GSNP06396 782 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CD36P16671 472 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 JUNDP17535 347 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 COPZ1P61923 177 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 PTGR1Q14914 329 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 USP43Q70EL4 1123 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 SPATC1Q76KD6 591 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 SVOPQ8N4V2 548 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 PSMG2Q969U7 264 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa20.14■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ILVBLA1L0T0 632 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 EFCAB9A8MZ26 197 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CXCL11O14625 94 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 KATNA1O75449 491 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ITGAMP11215 1152 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 IGFBP5P24593 272 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 EPHA2P29317 976 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 GGT5P36269 586 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 GJA5P36382 358 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CAMK2BQ13554 666 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 MARC1Q5VT66 337 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 UBE2FQ969M7 185 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 NCLNQ969V3 563 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 DCSTAMPQ9H295 470 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 MARCH7Q9H992 704 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 SLC6A13Q9NSD5 602 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 LCHNA4D1U4 455 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ARVCFO00192 962 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 RGS13O14921 159 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 DYRK3O43781 588 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 GUCY1B2O75343 617 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 MLYCDO95822 493 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 RENBPP51606 427 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 NR6A1Q15406 480 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 GPR150Q8NGU9 434 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 OR4L1Q8NH43 312 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 GTF2H4Q92759 462 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.13■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ELOVL7A1L3X0 281 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 SSX4O60224 188 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CAPN1P07384 714 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 VAC14Q08AM6 782 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 SYT16Q17RD7 645 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CEP68Q76N32 757 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ATL1Q8WXF7 558 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CPA4Q9UI42 421 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 ISPDA4D126 451 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 STX16O14662 325 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 SERPINA1P01009 418 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 SCNN1GP51170 649 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CLCNKBP51801 687 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 RAD51Q06609 339 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 IL18R1Q13478 541 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 CARD16Q5EG05 197 aa20.12■□□□□ 0.81
PMS1-222ENST00000639501 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms