RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460605.1

GTPBP1-204, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-204	ENST00000460605	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GTPBP1-204	ENST00000460605	TRIB3	Q96RU7	358 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZNF670	Q9BS34	389 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GTPBP1-204	ENST00000460605	NDC1	Q9BTX1	674 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GTPBP1-204	ENST00000460605	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GTPBP1-204	ENST00000460605	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GTPBP1-204	ENST00000460605	PKP3	Q9Y446	797 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GTPBP1-204	ENST00000460605	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		10.46	□□□□□ -0.73
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	DYTN	A2CJ06	578 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	LGALS16	A8MUM7	142 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	NDST3	O95803	873 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	SPAM1	P38567	509 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	LMAN1	P49257	510 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	PCSK7	Q16549	785 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	C1orf189	Q5VU69	101 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	SARM1	Q6SZW1	724 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	NR4A3	Q92570	626 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	DLG3	Q92796	817 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCDC120	Q96HB5	630 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	PPM1M	Q96MI6	270 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	SYT11	Q9BT88	431 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	WDR54	Q9H977	334 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	IL26	Q9NPH9	171 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	FANCL	Q9NW38	375 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	HACD3	Q9P035	362 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CDC23	Q9UJX2	597 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	MTOR	P42345	2549 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	SVIL	O95425	2214 aa		10.45	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	MYO1F	O00160	1098 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	KCNK1	O00180	336 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	ALB	P02768	609 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CBSL	P0DN79	551 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	RALB	P11234	206 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	TCF4	P15884	667 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CBS	P35520	551 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CA7	P43166	264 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CTSC	P53634	463 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	ARSF	P54793	590 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	KCNK10	P57789	538 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	ARG2	P78540	354 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	MFAP5	Q13361	173 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	DPYSL3	Q14195	570 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	FKBP10	Q96AY3	582 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	PCM1	Q15154	2024 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	PCSK5	Q92824	1860 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	BTN3A1	O00481	513 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	FANCG	O15287	622 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	PMPCB	O75439	489 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	UMOD	P07911	640 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	PBX1	P40424	430 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	AP1B1	Q10567	949 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	SPESP1	Q6UW49	350 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CEP97	Q8IW35	865 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GTPBP1-204	ENST00000460605	CNTD1	Q8N815	330 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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