RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 HIC2Q96JB3 615 aa20.52■□□□□ 0.88
GPC1-202ENST00000420138 EGFL8Q99944 293 aa20.52■□□□□ 0.88
GPC1-202ENST00000420138 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
GPC1-202ENST00000420138 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 CPA2P48052 419 aa20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 PREPP48147 710 aa20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 KLF10Q13118 480 aa20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 SP140Q13342 867 aa20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 NXNQ6DKJ4 435 aa20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 FBXO27Q8NI29 283 aa20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.51■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 B2RBV5 119 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 PIP5K1BO14986 540 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 PCCBP05166 539 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 GGT5P36269 586 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 GTF2H2Q13888 395 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 CCINQ13939 588 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 NAA25Q14CX7 972 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 MSANTD3Q96H12 275 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 CATSPER2Q96P56 530 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 CDK15Q96Q40 435 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 LGR4Q9BXB1 951 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TIMM22Q9Y584 194 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 VEGFDO43915 354 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 DNTTP04053 509 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ANXA5P08758 320 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 PDHA2P29803 388 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 PKNOX1P55347 436 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 RBBP7Q16576 425 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ICE2Q659A1 982 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 LETMD1Q6P1Q0 360 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 FAM3CQ92520 227 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 MARK4Q96L34 752 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ARL15Q9NXU5 204 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 WWOXQ9NZC7 414 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 KRT87PA6NCN2 255 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ATP6AP2O75787 350 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 OR4F21O95013 312 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 GSTM1P09488 218 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ADPRHP54922 357 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 CDK3Q00526 305 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 GSTM4Q03013 218 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TRAF3Q13114 568 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TMEM92Q6UXU6 159 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 FOXJ1Q92949 421 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TMEM159Q96B96 161 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 GPR34Q9UPC5 381 aa20.49■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 K7EPI3 171 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 UROSP10746 265 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 EPORP19235 508 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 CD72P21854 359 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TRIM23P36406 574 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 SYTL3Q4VX76 610 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 TEX101Q9BY14 249 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 AKTIPQ9H8T0 292 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 IPPKQ9H8X2 491 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 BTRCQ9Y297 605 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 PIK3R1P27986 724 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 SLC6A12P48065 614 aa20.48■□□□□ 0.87
GPC1-202ENST00000420138 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms