RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PSMD11O00231 422 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 FPGTO14772 594 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TBX1O43435 398 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TPST2O60704 377 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TRBC1P01850 177 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAJB13P59910 316 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 OR13J1Q8NGT2 312 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HM13Q8TCT9 377 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 UROC1Q96N76 676 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 VPS35Q96QK1 796 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MAGEH1Q9H213 219 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF195O14628 629 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 KRT75O95678 551 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 GSRP00390 522 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HOXD10P28358 340 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 VBP1P61758 197 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CRHR2Q13324 411 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 LRP8Q14114 963 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ABRAXAS2Q15018 415 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CHRNA6Q15825 494 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CLEC14AQ86T13 490 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 YME1L1Q96TA2 773 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 BOCQ9BWV1 1114 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 BRD9Q9H8M2 597 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM17Q9Y577 477 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 A0A1B0GVM2 712 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC28A1O00337 649 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 VILLO15195 856 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TSC22D2O75157 780 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 NDUFS2O75306 463 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CLDN9O95484 217 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PGRP06401 933 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 OGNP20774 298 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CSKP41240 450 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MAP2K4P45985 399 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MXD1Q05195 221 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 DGKKQ5KSL6 1271 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 KCTD11Q693B1 232 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF614Q8N883 585 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TAMM41Q96BW9 452 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MTERF3Q96E29 417 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 OSER1Q9NX31 292 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC25A13Q9UJS0 675 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CPQQ9Y646 472 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SMIM30A4D0T7 59 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 LCHNA4D1U4 455 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 PER2O15055 1255 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CBFA2T3O75081 653 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 ESR1P03372 595 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RGRP47804 291 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP4F8P98187 520 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 NFKB2Q00653 900 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 CACNG1Q06432 222 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 USP45Q70EL2 814 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RANBP9Q96S59 729 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 HIPK3Q9H422 1215 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD42-202ENST00000393389 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms