RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 KPNA5O15131 536 aa16.01■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 GPIP06744 558 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 WEE1P30291 646 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 SERPINB10P48595 397 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 LRP8Q14114 963 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 DET1Q7L5Y6 550 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 PROSER1Q86XN7 944 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 C3orf30Q96M34 536 aa16.01■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 K7ERQ8 282 aa16.01■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 GNPDA1P46926 289 aa16.01■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 C5orf22Q49AR2 442 aa16.01■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 ITFG1Q8TB96 612 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 DMTF1Q9Y222 760 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa16.01■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 GRIK2Q13002 908 aa16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 AADATQ8N5Z0 425 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 CD200R1Q8TD46 325 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 FIG4Q92562 907 aa16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 RERGLQ9H628 205 aa16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 SUV39H2Q9H5I1 410 aa16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 TNFRSF21O75509 655 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 TRBC1P01850 177 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 RFC2P35250 354 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 UFM1P61960 85 aa16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 SCAIQ8N9R8 606 aa16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 UGT2B28Q9BY64 529 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 ABCG8Q9H221 673 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 AIG1Q9NVV5 245 aa16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 ALOX12P18054 663 aa16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 TTC30BQ8N4P2 665 aa16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 LRTM1Q9HBL6 345 aa16■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 TEX28O15482 410 aa15.99■□□□□ 0.15
CTCF-201ENST00000264010 MATN4O95460 622 aa15.99■□□□□ 0.15
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CTCF-201ENST00000264010 FOXB2Q5VYV0 432 aa15.99■□□□□ 0.15
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